Claude ha diseñado una proteína que se une a la toxina del escorpión

Anthropic ha puesto a prueba la capacidad de Claude para trabajar con herramientas, esta vez en el diseño de proteínas. El estudio de la empresa, publicado el 20 de octubre, revela que el modelo generó 318 484 diseños candidatos en 64 horas. Tras las evaluaciones de laboratorio, se identificaron 17 diseños que se unen a las toxinas de escorpión. Sin embargo, el estudio aún no demuestra que se haya desarrollado un antídoto que pueda utilizarse en humanos ni que elimine el efecto del veneno.

En el estudio se utilizó una versión de Claude no publicada y destinada a fines de investigación, diferente de la sesión de chat estándar a la que todo el mundo tiene acceso. El modelo funcionó en el entorno Claude Science con herramientas para el diseño y la evaluación de proteínas. Esta distinción es importante, ya que el resultado descrito no ofrece una característica de producto lista para usar que pueda reproducirse directamente escribiendo la misma solicitud en un cuadro de chat normal.

Los investigadores se centraron en cinco neurotoxinas relacionadas con especies de escorpiones de México, Brasil, el norte de África y Oriente Medio. Tras generar numerosos diseños con el modelo, el equipo seleccionó un grupo más reducido para su evaluación real en el laboratorio. No todos los candidatos que parecían prometedores en el ordenador dieron el mismo resultado en el experimento.

Además, el paquete de datos abiertos de Anthropic publica por separado los resultados de los 211 diseños evaluados. Adaptyv Bio y Twist Bioscience midieron la unión mediante el método de resonancia plasmónica superficial. Los datos incluyen no solo los ejemplos que tuvieron éxito, sino también los diseños que no mostraron unión o cuyo resultado quedó indeterminado. De este modo, es posible comparar la descripción resumida de la empresa con los registros detallados de los experimentos.

Según la descripción del paquete de datos, de los 17 ligandos, siete están dirigidos a la toxina Cn2, cuatro a la AaH II, cuatro a la AaH I y dos a la LqhIII. No se ha encontrado ningún ligando que cumpla los mismos criterios para Ts1. Además, LqhIII solo se ha medido en Adaptyv Bio. Por lo tanto, no sería correcto afirmar que todos los diseños exitosos se han validado con el mismo experimento en ambos laboratorios.

La unión a la toxina no implica que se haya neutralizado el veneno

Por otra parte, el hecho de que una proteína se una a una toxina concreta no demuestra por sí solo que dicha toxina haya dejado de actuar sobre las células nerviosas. La descripción de los datos señala específicamente que la neutralización esperada para la Cn2-B1 aún no se ha comprobado en células mediante métodos de registro eléctrico. Este resultado describe una etapa de investigación previa al éxito del tratamiento.

Además, el estudio se llevó a cabo con toxinas específicas preparadas en el laboratorio. No se analizaron en el mismo experimento todos los componentes del veneno real de escorpión, ni su comportamiento, seguridad y persistencia en un organismo vivo. Por lo tanto, el éxito de la unión descrito no demuestra la seguridad ni la eficacia de un producto que pueda utilizarse en un hospital.

Los investigadores han puesto a disposición del público sus diseños, registros de mediciones y estructuras estimadas bajo una licencia CC BY 4.0. Esta publicación permite a otros equipos examinar los resultados y planificar nuevos experimentos. En la siguiente fase, lo decisivo no será solo que los candidatos se unan a la toxina, sino medir si realmente bloquean su efecto biológico.